肛门周围的组织内发生的化脓性感染，是肛管与肛门周围组织间隙及肛周皮肤之间形成的有细菌污物的通道。内口多位于齿状线附近，外口位于肛周皮肤处。整个瘘管壁由增厚的纤维组织组成，内复一层肉芽组织，经久不愈。发病率仅次于痔。本病多为一般化脓性感染所致，少数为特异性感染，如结核、克罗恩病、溃疡性结肠炎等。性激素的影响也是发病原因之一。
(1)括约肌间肛瘘：多为低位肛瘘，较常见，约占70%，为肛管周围脓肿的后果。瘘管只穿过内括约肌，外口常只有1个，距肛缘较近，约3～5cm。少数肛管向上，在直肠环肌和纵肌之间形成盲端或穿入直肠形成高位括约肌间瘘。
(2)经括约肌肛瘘：可以为低位或高位肛瘘，约占25%，为坐骨直肠窝脓肿的后果。瘘管穿过内括约肌、外括约肌浅部和深部之间，外口常有数个，并有支管互相沟通。外口距肛缘较近，约5cm左右，少数瘘管向上穿过肛提肌到直肠旁结缔组织内，形成骨盆直肠瘘。
(3)括约肌上肛瘘：为高位肛瘘，少见，占5%。瘘管向上穿过肛提肌，然后向下至坐骨直肠窝穿透皮肤。由于瘘管常累及肛管直肠环，故治疗较困难，常需分期手术。
(4)括约肌外肛瘘：为高位肛瘘，少见，占5%。瘘管向上穿过肛提肌，然后向下至坐骨直肠窝穿透皮肤。由于瘘管常累及肛管直肠环，故治疗较困难，常需分期手术。
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